Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp19Q3UJD6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms