Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc34Q3UI66 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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