Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Nkx6-3Q3UHX8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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