Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Cops9Q3U898 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms