Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Rnf149Q3U2C5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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