Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hace1Q3U0D9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms