Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf3c3Q3TMP1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms