Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc10Q3TLI0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc10Q3TLI0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms