Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trappc13Q3TIR1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms