Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms