Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Zbtb38Q3LR78 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Zbtb38Q3LR78 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zbtb38Q3LR78 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms