Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim71Q1PSW8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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