Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cers3Q1A3B0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms