Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ptchd1Q14B62 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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ptchd1Q14B62 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms