Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rpusd3Q14AI6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Rpusd3Q14AI6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rpusd3Q14AI6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rpusd3Q14AI6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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