Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hoxc4Q08624 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc4Q08624 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc4Q08624 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hoxc4Q08624 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxc4Q08624 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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