Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm3Q08189 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms