Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnn2Q08093 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms