Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gdf3Q07104 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms