Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Emx2Q04744 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms