Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccl7Q03366 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms