Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ascl1Q02067 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms