Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms