Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itga4Q00651 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Itga4Q00651 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms