Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gfra1P97785 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms