Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nbr1P97432 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nbr1P97432 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Nbr1P97432 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nbr1P97432 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nbr1P97432 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nbr1P97432 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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