Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SmsP97355 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SmsP97355 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SmsP97355 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms