Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arf1P84078 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arf1P84078 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arf1P84078 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Arf1P84078 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Arf1P84078 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms