Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Setd4P58467 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms