Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
FmodP50608 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FmodP50608 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FmodP50608 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms