Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LtbrP50284 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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LtbrP50284 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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