Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TgfaP48030 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TgfaP48030 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
TgfaP48030 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms