Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms