Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ItgavP43406 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ItgavP43406 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms