Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx1-2P42580 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx1-2P42580 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms