Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nedd1P33215 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms