Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms