Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
VtnP29788 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
VtnP29788 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms