Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms