Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChgaP26339 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms