Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pou2f1P25425 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pou2f1P25425 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Pou2f1P25425 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pou2f1P25425 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms