Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pde6bP23440 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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