Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Eif3aP23116 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms