Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RarbP22605 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RarbP22605 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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RarbP22605 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RarbP22605 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RarbP22605 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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