Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SftpcP21841 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms