Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prim1P20664 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms