Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fcer1aP20489 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms