Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P18533 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18533 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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P18533 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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P18533 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18533 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18533 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18533 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18533 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18533 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms