Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Pou4f1P17208 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms