Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms